日本の野生のミツバチです。木の洞(うろ)などの閉鎖的な空間に巣を作って生活しています。他にも、民家の屋根裏、床下、擁壁の中にできた空洞など、狭い入り口と閉鎖空間に巣を作ります。一般の養蜂には外来種のセイヨウミツバチが使われており、ニホンミツバチのハチミツは幻と呼ばれるほど貴重です。